摘要：La diversidad de los microorganismos asociados a la rizosfera de diferentes especies vegetales en los suelos en México ha sido poco estudiada y ha sido abordada convencionalmente con técnicas microbiológicas las cuales son limitadas debido a que existe un porcentaje elevado de microorganismos no-cultivables (95-99%). El presente trabajo usa la secuenciación del ADN ribosomal (ADNr) para evitar esta limitante y explorar mejor la diversidad de los microorganismos cultivables y no-cultivables asociados a tomate (Solanum lycopersicum, L.) en un agroecosistema en Sinaloa. Se empleó ADN genómico extraído de la suelo rizosferico para amplificar una región hipervariable en el ADNr empleando oligonucleótidos universales para ADNr procariota y eucariota. El análisis de de 476 y 441 secuencias de ADNr de origen procariótico y eucariótico respectivamente, mostró que los phyla eucariotes más abundantes fueron: Ascomycota (62.1%), Chlorophyta (17.6%) y Basidiomycota (11.4%); y los de origen procariote más abundantes fueron Firmicutes (43%), Acidobacteria (17.2%) y Proteobacteria (11.6%). El presente trabajo representa, hasta donde tenemos información, la caracterización más completa de la diversidad de microorganismos de la rizosfera asociados a tomate a la fecha. Se discute el papel que especies pertenecientes a géneros procariotas (Bacillus y Paenibacillus) y eucariotas (Alternaria) pudieran jugar en el control biológico de fitopatogénos en la rizosfera.
其他摘要：Rhizosphere microorganism diversity associated to different plant species in Mexican soils has been understudied. Most of those studies have been done using conventional microbiological techniques, which, although useful, present a limitation their incapacity to detect unculturable microorganisms, which represent 95-99% of the total microorganisms in soils. The present work employs ribosomal DNA (rDNA) sequencing to overcome this limitation and to improve exploration of the diversity of culturable and non-culturable microorganisms associated to tomato (Solanum lycopersicum, L.) in an agroecosystem from Sinaloa. Genomic DNA from rhizospheric soil was extracted and a hypervariable region on the rDNA was amplified using universal oligonucletides directed to amplify prokaryotic and eukaryotic rDNA. Sequence analysis of 476 and 441 rDNA clones of prokaryotic and eukaryotic origin respectively showed the most abundant phyla. In Eukaryotes, they were Ascomycota (62.1%), Chlorophyta (17.6%) and Basidiomycota (11.4%). The most abundant prokaryotic phyla were Firmicutes (43%), Acidobacteria (17.2%) and Proteobacteria (11.6%). The present work represents, to the best of our knowledge, the most complete characterization of the microorganism diversity associated to tomato rhizosphere. The work discusses the role that species belonging to genuses from prokaryotic (Bacillus and Paenibacillus) or eukaryotic origin (Alternaria) may play in biological control of phytopathogens in the rhizosphere.
