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文章基本信息

  • 标题:El estudio de la biodiversidad en la era de la secuenciación masiva
  • 其他标题:The study of biodiversity in the era of massive sequencing
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  • 作者:Escalante, Ana E. ; Jardón Barbolla, Lev ; Ramírez-Barahona, Santiago
  • 期刊名称:Revista Mexicana de Biodiversidad
  • 印刷版ISSN:1870-3453
  • 出版年度:2014
  • 卷号:85
  • 期号:4
  • DOI:10.7550/rmb.45985
  • 语种:English
  • 出版社:Instituto de Biología
  • 摘要:Recientemente se han desarrollado nuevas tecnologías de secuenciación masiva, conocidas comosecuenciación de siguiente generación (NGS, por sus siglas en inglés). Estas tecnologías permiten secuenciaciónrápida, masiva y a bajo costo de regiones genómicas o genomas completos, haciendo posible estudios genómicos deorganismos no modelo y estudios metagenómicos. Estas tecnologías prometen expandir las aproximaciones molecularesde estudios ecológicos y evolutivos hacia asuntos relacionados con conservación y manejo de la diversidad biológicaante retos como cambio climático. Entre las plataformas NGS disponibles hay diferencias fundamentales que resultanen diferente precisión en la determinación de las secuencias, así como diferencias en la longitud de las mismas.Algunas diferencias clave entre plataformas son los procedimientos para la preparación de bibliotecas (cuando sonnecesarias) y el proceso de secuenciación per se (e.g., pirosecuenciación, síntesis).
  • 其他摘要:Recent years have witnessed the advent and rapid development of massive sequencing technology, commonlyknown as Next Generation Sequencing (NGS). This technology allows for rapid, massive and inexpensive sequencingof genome regions or entire genomes, making possible genomic studies of non-model organisms and has seen greatprogress in metagenomic studies. The promise of this information-rich era is to expand the molecular approach ofecological and evolutionary studies towards urgent issues related with conservation and management of biologicaldiversity in the face of global change. Among the current NGS technologies, there are fundamental differences thatimpact DNA sequence accuracy, length and range of applications. Key differences among platforms are the procedurefor library preparation (when needed) and the sequencing process itself (e.g., pyrosequencing, synthesis). In thisreview we describe the technical details of commercially available platforms for massive sequencing.
  • 关键词:secuenciación masiva en paralelo; secuenciación de siguiente generación; genómica; metagenómica.
  • 其他关键词:massively parallel sequencing; next-generation sequencing; genomics; metagenomics.
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