摘要:This research was aimed to identify the changes of nucleotide (Single Nucleotide Polymorphism) growth hormone gene in the population of Aceh cattle. There were 44 samples of DNA sequenced, and a few samples from Gen Bank (M57764). Based on the analysis using MEGA program, it was identified one new mutation on exon five on 2230 bp in which C nucleotide turned into T nucleotide, and this was called Silent Mutation (Leusine-Leusine/ CTC-CTT). The frequency of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) genotype on 2230 bp (C/T) was CC (0.36), TT (0.14) and CT (0.50). The genotype TT was not possessed by Aceh cattle from Saree, but possessed by those from Banda Aceh and Indrapuri. Chi-square test showed not significant differences in allele frequencies for three population. The frequency of genotype SNP on 2291 bp (A/C) was AC (0.11) and CC (0.89). The frequency of allele C was higher than allele A and T.
其他摘要:Tujuan penelitian ini untuk mengidentifikasikan perubahan basa nukleotida (Single Nucletide Polymorphism) gen hormon pertumbuhan pada sapi Aceh. Sampel DNA yang berhasil disekuen berjumlah 44 sampel, serta menggunakan sampel sekuen yang berasal dari Gen Bank (M57764). Berdasarkan analisis dengan menggunakan sofware program MEGA, penelitian ini mengidentifikasi adanya satu titik mutasi baru pada ekson lima diposisi 2230 bp, yaitu terjadi perubahan basa C menjadi basa T, yang merupakan Silent Mutation (Leusine–Leusine/ CTC–CTT). Frekuensi genotipe SNP pada posisi 2230 bp (C/T) adalah CC (0,36), TT (0,14) dan CT (0,50). Genotipe TT tidak dimiliki oleh populasi sapi Aceh yang berasal dari Saree, tetapi dimiliki oleh populasi yang berasal dari Banda Aceh dan Indrapuri. Berdasarkan hasil uji Chi-Square menunjukkan tidak terdapat perbedaan frekuensi alel dari ketiga populasi. Frekuensi genotipe SNP pada posisi 2291 bp (A/C) adalah AC (0,11) dan CC (0,89). Frekuensi alel C memiliki nilai yang lebih tinggi daripada frekuensi alel A dan alel T.