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文章基本信息

  • 标题:w-M2Align: una herramienta web para el alineamiento múltiple de secuencias basada en información estructural de las proteínas
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  • 作者:Cristian Zambrano Vega ; Byron Oviedo ; Emilio Zhuma
  • 期刊名称:Universidad y Sociedad
  • 电子版ISSN:2218-3620
  • 出版年度:2022
  • 卷号:14
  • 页码:69-76
  • 语种:Spanish
  • 出版社:Universidad de Cienfuegos
  • 摘要:Este artículo presenta w-M2Align, una herramienta web fácil e intuitiva de usar para el alineamiento múltiple de secuencias de proteínas basada en la metaheurística multiobjetivo M2Align, cuyo criterio de calidad a optimizar son: STRIKE, basado en la información estructural de las proteínas, el Número de Columnas Totalmente Alineadas y el Porcentaje de Non-Gaps, los cuales están basados en la conservación de la estructura de las secuencias. El formato de las secuencias biológicas sin alinear es compatible con el formato FASTA y la información estructural de las proteínas puede ser obtenida automáticamente desde el sitio web del Protein Data Bank (PDB) o proporcionada por el usuario. Todos los cálculos se llevan a cabo en un clúster de computadora dedicado y los usuarios reciben los resultados a través de URL o correo electrónico. La plataforma permite descargar los ficheros con los resultados finales (Aproximaciones al Frente de Pareto y el conjunto de alineamientos generados en formato FASTA). El software W-M2Align está disponible en la dirección web http://revistas.uteq.edu.ec/m2align/, de forma gratuita y no requiere de inicio de sesión para su uso.
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