摘要：O programa Institucional de Bolsa de Iniciação à Docência (PIBID) tem uma importância significativa na educação brasileira, pois, contribui com a formação inicial e continuada dos professores ampliando o elo entre universidades e escolas públicas. o principal objetivo deste artigo é relatar a elaboração e aplicação de uma proposta didática sobre o ensino de biologia por investigação desenvolvida em uma escola núcleo do PIBID. O Ensino por Investigação é uma alternativa para superar o modelo tradicional de ensino que simplifica e limita as potencialidades dos estudantes, mas, continua sendo bastante adotado ainda nas escolas. A formatação pedagógica que caracterizam a abordagem dos Três Momentos Pedagógicos em três etapas: Problematização inicial, Organização do conhecimento e Aplicação do conhecimento e foi desenvolvida em quatro aulas do componente curricular de biologia. Por fim, ministrar aula de ciências por investigação propiciou um maior aprofundamento nos conteúdos relativos às Ciências, além de uma abordagem participativa e reflexiva e autônoma por parte dos bolsistas e supervisora da escola núcleo.
