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  • 标题:Asociación de genoma completo para el hábito de crecimiento en trigo harinero (Triticum aestivum L.)
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  • 作者:Ana L. Gómez-Espejo ; Carolina P. Sansaloni ; Juan Burgueño
  • 期刊名称:Ecosistemas y recursos agropecuarios
  • 印刷版ISSN:2007-9028
  • 出版年度:2021
  • 卷号:8
  • 期号:2
  • DOI:10.19136/era.a8n2.2912
  • 语种:Spanish
  • 出版社:Universidad Juárez Autónoma de Tabasco, Dirección de Investigación y Posgrado
  • 摘要:El hábito de crecimiento de los trigos harineros (primavera e invierno) estádeterminado primordialmente por el proceso de vernalización, regulado por losgenes Vrn. Algunos estudios sugieren la implicación de otros genes en ladiferenciación de dicha característica. Por ello, se tiene por objetivo laidentificación genómica de regiones con una posible relación funcional al hábitode crecimiento. Se realizó un estudio de asociación del genoma completo (GWAS)con dos enfoques de análisis: a) FarmCPU (Unificación de Probabilidad Circulantede Modelo fijo y aleatorio) y b) BLINK (Información Bayesiana y Desequilibrio deligamiento Anidado Iterativamente) implementados en el paquete GAPIT de R. Seutilizaron datos de 25 681 loci de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP’s) de7 757 colectas de del banco de germoplasma delCIMMYT clasificadas en cuanto a su hábito de crecimiento. Se identificaron 593marcadores SNP’s con una alta asociación al hábito de crecimiento (p < 0.01).Pero solo 70 marcadores formaban bloques de asociación (BA) en 11 cromosomas.Como se esperaba, se identificó un BA cercano al gen Vrn1 en el cromosoma 5A.Adicionalmente se identificaron 20 regiones genómicas (BA) con asociación alhábito de crecimiento, en las que se detectó la presencia de proteínas derespuesta al estrés implicadas en procesos de aclimatación y des-aclimatación.Los resultados sugieren la participación de nuevos genes en la determinación delhábito de crecimiento en y su potencialpredictivo en colectas no clasificadas.
  • 关键词:Stress; GWAS; growth habit; SNP’s; bread wheat
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