GMパパイヤ(55-1)を検査対象とし，23の協力機関に共通未知試料を送付し，GUS法，および定性PCR法の2法について，外部精度管理試験を実施した．各機関から報告された試験結果の解析を行ったところ，両法ともに送付試料の内容と一致する結果が得られた．定性PCR法を用いた試験において，検出用プライマー対を用いた試験の結果，陰性検体を対象とした試験区において，予定バンド長に一致する増幅バンドが認められ，確認試験を実施したが，増幅バンドが得られず，最終判定を陰性とした事例が1機関から報告された．この事例については，他機関から報告された結果との比較，およびアンケート調査結果から，試験実施者の手技に起因したコンタミネーションを原因とする擬陽性判定であると判断された．一方，GUS法による試験区においては，すべての機関において正しく判定された．