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  • 标题:DNA塩基配列を利用した真菌の同定:国産玄米から分離された Fusarium の種レベルの同定
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  • 作者:酒井 綾子 ; 尾関 由姫恵 ; 佐々木 洋介
  • 期刊名称:食品衛生学雑誌
  • 印刷版ISSN:0015-6426
  • 电子版ISSN:1882-1006
  • 出版年度:2006
  • 卷号:47
  • 期号:6
  • 页码:268-276
  • DOI:10.3358/shokueishi.47.268
  • 出版社:The Food Hygienic Society of Japan
  • 摘要:

    国産玄米から分離した Fusarium を材料としてDNA塩基配列による真菌の同定を行い,その実践上の有用性と限界について検討した.rRNA遺伝子内に存在する3領域,D2, ITS1およびITS2の塩基配列を解読し,米国のNCBIが管理するGenBankデータベースに登録されているDNA塩基配列と照合した.D2領域については,Applied Biosystems Fungal Library とも照合した. Fusarium を種レベルで同定または推定するには,少なくとも3領域すべてをデータベースと照合する必要があった.今回同定に供した株の約半数は,塩基配列のみから種の同定が可能であった.残りの株は,1株を除いて,DNA塩基配列に基づいて候補となる種を絞ることができ,形態学的手法による同定が容易になった.

  • 关键词:真菌の同定; DNA塩基配列; 遺伝子解析; 国産米
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