市販食品由来の酵母20株について，rDNAの2領域を対象にしたユニバーサルプライマーを用いたDNA塩基配列解析による同定を試みるとともに，API 20C AUXを用いた表現性状試験による同定結果と比較した．この結果，26S領域では食品から分離した酵母20株すべてが種レベルまで同定された．ITS1領域では，16株が種レベルまで同定された．また，表現性状試験およびDNA塩基配列解析による同定結果はすべての株が属レベルで一致した．さらに，食品苦情2事例において表現性状試験のみでは同定が困難であった酵母は，DNA塩基配列解析によって同定が可能となった．