医学分野における研究論文は，収録対象とする主題分野の異なるさまざまなデータベースに収録されることが多い。各データベースは，索引語付与に着目すると特徴的な傾向を持って互いに異なっていることを，既報において報告した。本報では，索引語付与に特徴の見られたMEDLINE，EMBASE，BIOSISを用いて大腸菌の抗菌物質研究に関する文献の索引語分析を行った。その結果，各データベースに示された差異や特徴は，細菌の違いにかかわらず同様の結果が得られた。特に，数量化III類による解析を行った結果では，MEDLINEでは「生物科学」，「人間の集団」，EMBASEでは「化学物質と医薬品」，「疾病」，BIOSISでは「生物体」のように，各データベースの索引語付与には特徴的な傾向があることが見いだされた。