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  • 标题:gyrB 遺伝子内部塩基配列に基づく飲料変敗細菌 Alioyclobacillus aoidoterrestris の鑑別法
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  • 作者:後藤 慶一 ; 浅原 未佳 ; 笠井 宏朗
  • 期刊名称:日本食品微生物学会雑誌
  • 印刷版ISSN:1340-8267
  • 电子版ISSN:1882-5982
  • 出版年度:2006
  • 卷号:23
  • 期号:3
  • 页码:149-155
  • DOI:10.5803/jsfm.23.149
  • 出版社:Japanese Society of Food Microbiology
  • 摘要:

    3株の A. acidoterrestris の gyrB 遺伝子塩基配列を決定し, その他の Alicyclobacillus 属細菌由来 gyrB 遺伝子塩基配列と相同性解析を実施したところ, gyrB遺伝子は A. acidoterrestris 内で高度に保存されていることがわかった (97.6%以上).その結果をもとに, A.acidoterrestris に特異的な領域を含むプライマー領域の検索を行ったところ, 5種類のプライマー (フォワード・プライマー: 3種類, リバース・プライマー: 2種類) を設計することができた.このプライマーの総当たりの組み合わせで, A. acidoterrestris 由来DNAを鋳型にPCR反応を実施したところ, いずれの組み合わせにおいても目的の長さの断片が増幅された.他方, A.acidoterrestris 以外の菌種については, 一部の菌株で目的の断片長ではない増幅産物が見られたが, ほとんどの場合で増幅産物は見られなかった.さらに, それらのプライマー領域をLAMP法へ応用したところ, A.acidoterrestris のみに遺伝子増幅が起こることが確認された.以上のことから, 設計したプライマーを用いてPCR-電気泳動法あるいはLAMP法を行うことにより, A. acidoterrestris を正確かっ短時間で鑑別可能であることが示された.

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