ECO636プローブは E.coli と Shigella 属に対して特異性を示した．汚染指標として E. coli を検出するためのFISHFC法におけるマイクロコロニー形成のための培養時間はSEL液体培地で7時間が最適であった． E. coli 新鮮培養菌を用いた FISHFC 法と平板塗抹法での生菌数には有意差は認められず（ p >0.05），さらに， E. coli を接種した食品サンプル（8種類）からの検出でも，FISHFC 法と平板塗抹法での生菌数値に有意差は認められなかった． したがって，本研究で設計した ECO636 プローブを用いた FISHFC 法による E. coli の定量検出法は，培養時間7時間およびFISH操作2時間の合計9時間で， E. coli を平板塗抹法と同等の精度かつ迅速に検出·定量できる方法であり，汚染指標としての E. coli 定量検出に有用な方法であることが明らかとなった．