コムギのDNA品種識別を行うために多様なコムギ加工食品に適用できる DNA 抽出法を比較検討した．3カ所の実験施設において，3種類の市販キット（DNeasy Plant Mini Kit，Genomic-tip 20/G， GM quicker 3）を用い，12種類のコムギ加工食品から DNA 抽出を行った．その結果，いずれの実験施設でも，3種類の抽出法によりすべての食品から DNA が抽出されたが，Genomic-tip 20/G のみ，すべての食品について O.D.260 nm/O.D.280 nm 値が1.7以上の高純度な DNA 溶液が得られた．いずれの実験施設でも，3種類の抽出法によって得られたすべての DNA 溶液から DNA マーカーによってコムギ由来の DNA が検出された．品種識別マーカーの一つである外国産コムギ検出マーカーでは，一部の食品において，実験施設によって増幅産物が得られないものや，増幅パターンのばらつきが見られた．食品の種類によってコムギ由来の DNA 量が異なることや，複数品種の DNA が混在していることから，特定品種の遺伝子型を検出する本マーカーでは検出が困難になる場合があると推測され，抽出法の違いに基づく影響は小さいと考えられた．したがって，いずれの抽出法も DNA マーカーの適用に対して十分に有用であり，確実な品種識別を行うためには，食品の種類および実験環境に応じてプライマー量や DNA 供試量等の実験条件を調整することが必要であると考えられた．コストや時間を考慮して最適な手法を選択することが望ましい．