緑茶飲料に様々な希釈倍率の大腸菌溶液を添加し，フローサイトメトリー（FCM）と培養法による大腸菌数測定に供試した．FCMでは，多重染色した菌および他の自家蛍光物質が発する蛍光をA，B，Cチャンネルの検出器で検出し，各チャンネルの電圧値をイベントとして記録した．FCMの従来法として，死菌の蛍光にのみ対応するBチャンネルの電圧が0で，A，Cチャンネルの電圧が閾値を超えたイベントの数を計数し，大腸菌数の予測値とした．また，A，Cチャンネルの電圧のヒストグラムを，あらかじめ定めた最適な階級幅を用いて作成し，水平に結合した．これにPartial least squares（PLS）回帰分析を適用し，大腸菌数を推定する検量線を作成した．FCMの従来法において，大腸菌数推定値の誤差の標準偏差（RMSE）は1.09-1.15 [log10 cfu/ml]であった．一方，PLS回帰分析による大腸菌数推定のRMSEは0.51 [log10 cfu/ml]であった．以上より，提案法により一般生菌数を高精度に推定可能なことが示唆された．