摘要:مقدمه: استخراج DNA از نمونه استخوانهاي قديمي همواره با مشکلات زيادی همراه است. روش فنول کلروفرم سيليکا یکی از روشهائی است که بهطور معمول برای این منظور استفاده ميشود. در اين مطالعه هدف بررسي و بهينهسازي مراحل این روش است.مواد و روشها: DNA 62 نمونه استخوان (داراي عمر 3 تا 11 سال) ابتدا با روش فنول کلروفرم معمولي و سپس با تغيير بعضي پارامترها استخراج شد. DNA حاصل در هشت منطقه STR به نامهاي CD4, vWA, LPL, D5S818, D16S539, D13S317, F13, FES توسط واکنش PCR تکثير شد و نتايج حاصل برروي ژل اکريلاميد مقايسه شد.نتایج: ميانگين بازدهي واکنش PCR، براي روش جديد و روش معمولی در هشت منطقه پليمورفيک ذکر شده بهترتيب 75%، 78%، 81%، 76%، 85%، 71%، 89%، 86%و 64%، 39%، 70%، 49%، 68%، 76%، 71%،28% بود.متوسط ميزان DNA حاصل از روش بهينه شده (در غلظت µl35 ذرات سيليکا) و معمولي بهترتیب برابر µg/ml 5/267 با خلوص 12/1 و µg/ml 76/192 با خلوص 84/0 بود.نتيجهگيري: طبق يافتههاي اين مطالعه بهنظر ميرسد تيمار طولانيتر با EDTA يکي از عوامل مؤثر حذف بهتر کلسيم باشد و همچنين غلظت مناسب ذرات محلول سيليکا ميتواند تأثير مهمي در حذف مهارکنندههاي PCR داشته باشد.
其他摘要:Introduction: DNA extraction from the ancient bones tissues is currently very difficult. Phenol chloroform silica method is one of the methods currently used for this aim. The purpose of this study was to optimize the assessment method. Methods: DNA of 62 bone tissues (average 3-11 years) was first extracted with phenol chloroform silica methods and then with changing of some parameters of the methods the extracted DNA was amplified in eight polymorphisms area including FES, F13, D13S317, D16, D5S818, vWA and CD4. Results from samples gained by two methods were compared in acrylamide gel.Results: The average of PCR yield for new method and common method in eight polymorphism regions was 75%, 78%, 81%, 76%, 85%, 71%, 89%, 86% and 64%, 39%, 70%, 49%, 68%, 76%, 71% and 28% respectively. The average of DNA in optimized (in 35l silica density) and common method were 267.5 µg/ml with 1.12 purity and 192.76 g/ml with 0.84 purity respectively.Conclusions: According to the findings of this study, it is estimated that longer EDTA attendance is an efficient agent in removing calcium and also adequate density of silica particles can be efficient in removal of PCR inhibitors.
关键词:واکنش PCR، پلیمورفیسم STR، روش استخراج فنل کلروفرم سيليکا.