Programas de revegetação de áreas degradadas por mineração visam recompor os processos essenciais do solo e ajudar na recuperação das comunidades fúngicas associadas. O objetivo deste estudo foi determinar a composição da comunidade de fungos filamentosos em áreas costeiras naturais e revegetadas de Mata Atlântica e fornecer informações sobre a regeneração da micobiota do solo em ambientes em recuperação. Cinquenta e duas espécies de fungos filamentosos foram identificadas. A análise ANOSIM indicou que as comunidades fúngicas diferem entre as áreas naturais e revegetadas (Rglobal = 0,186; p < 0,0001). Penicillium citreonigrum foi um indicador de áreas naturais, mas nenhuma espécie foi um indicador das áreas revegetadas. Áreas revegetadas apresentaram maior riqueza de espécies, demonstrando que a revegetação contribuiu para a recuperação e aumento da diversidade de fungos. Os resultados enfatizam a importância de inventários de biodiversidade em áreas costeiras sujeitas a pressões naturais e antrópicas, destacando a necessidade de políticas de conservação.