摘要：OBJETIVO: Avaliar um algoritmo para detecção da variação da incidência da malária nos municípios da Amazônia brasileira. MÉTODOS: Avaliou-se um sistema de monitoramento automatizado, baseado em um algoritmo desenvolvido anteriormente pelos autores. O algoritmo utiliza o diagrama de controle por quartis para classificação dos municípios em quatro grupos, conforme a variação da incidência da malária: grupo 1 (redução da incidência)-aqueles com incidência abaixo dos valores esperados; grupo 2 (incidência esperada)-aqueles com incidência dentro dos valores esperados; grupo 3 (epidemia)-aqueles com incidência acima dos valores esperados; grupo 4 (caso esporádico)-aqueles com apenas um caso durante o ano. O período de análise foi de 2003 a 2010. Foram estudados todos os municípios existentes nos nove estados que compõem a Amazônia brasileira (805 municípios em 2003 e 807 a partir de 2004). RESULTADOS: Com base nessa metodologia, os municípios da região foram assim classificados: grupo 1, 152 municípios (18,8% da região) em 2003 e 109 (13,5%) em 2010; grupo 2, 206 (25,6%) em 2003 e 331 (41,0%) em 2010; grupo 3, 391 (48,6%) em 2003 e 308 (38,2%) em 2010; e grupo 4, 56 (7,0%) em 2003 e 59 (7,3%) em 2010. CONCLUSÕES: O algoritmo possibilitou verificar que, na Amazônia brasileira, o número de municípios com epidemias de malária em 2010 diminuiu em relação a 2003, enquanto o número de municípios com incidência esperada aumentou. No mesmo período, houve pouca variação no número de municípios com redução da incidência e daqueles com casos esporádicos.
