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文章基本信息

  • 标题:Molecular docking of rutenum complex with epiisopyloturin and nitric oxide against nucleoside diphosphate kinase protein Leishmania
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  • 作者:Joabe Lima Araújo ; Gardênia Taveira Santos ; Lucas Aires de Sousa
  • 期刊名称:Research, Society and Development
  • 电子版ISSN:2525-3409
  • 出版年度:2020
  • 卷号:9
  • 期号:2
  • 页码:1-12
  • DOI:10.33448/rsd-v9i2.2121
  • 出版社:Grupo de Pesquisa Metodologias em Ensino e Aprendizagem em Ciências
  • 摘要:A leishmaniose é uma doença infecciosa que afeta animais e humanos, causada por parasitas flagelados pertencentes ao gênero Leishmania, podendo apresentar-se em diferentes formas clínicas, dependendo da cepa infectante e da reação imune do hospedeiro. Estima-se que a doença atinja cerca de 700.000 a 1 milhão de pessoas, causando a morte de 20 a 30.000 indivíduos anualmente. Assim, o presente estudo tem como objetivo realizar uma simulação de acoplamento molecular do complexo de rutênio com epiisopiloturina e óxido nítrico contra a proteína Nucleosídeo difosfato cinase de Leishmania amazonensis . A molécula em 3D NDK foi extraída do banco de dados de proteínas e ácidos nucleicos PDB. A estrutura molecular 3D do complexo Epiruno 2 foi projetada usando o software gaussview 5.0 . O alvo NDK e o complexo Epiruno 2 foram preparados para simulações de ancoragem, onde o NDK foi considerado rígido e o Epiruno 2 foi considerado flexível. O complexo Epiruno 2 apresentou boa taxa de afinidade molecular com a proteína alvo, tornando-o atrativo para ensaios experimentais em laboratórios para a proteína NDK da Leishmania e NDKs de outros patógenos, no entanto, o fármaco miltefosina apresentou baixa afinidade molecular para o mesmo alvo, corroborando com estudos apresentados na literatura sobre a eficácia reduzida dos medicamentos atuais contra a leishmaniose.↓La leishmaniasis es una enfermedad infecciosa que afecta a animales y humanos, causada por parásitos flagelados pertenecientes al género Leishmania, y puede presentarse en diferentes formas clínicas, dependiendo de la cepa infectante y la reacción inmune del huésped. Se estima que la enfermedad afecta a alrededor de 700,000 a 1 millón de personas, causando la muerte de 20 a 30,000 personas anualmente. Por lo tanto, el presente estudio tiene como objetivo realizar una simulación de acoplamiento molecular del complejo de rutenio con epiisopiloturina y óxido nítrico contra la proteína nucleósido difosfato quinasa de Leishmania amazonensis . La molécula 3D NDK se extrajo de la base de datos de proteínas y ácidos nucleicos PDB. La estructura molecular 3D del complejo Epiruno 2 se diseñó utilizando el software gaussview 5.0. El proteína NDK y el complejo Epiruno 2 fueron preparados para simulaciones de anclaje, donde NDK se consideró rígido y Epiruno 2 se consideró flexible. El complejo Epiruno 2 tenía una buena tasa de afinidad molecular con la proteína, lo que lo hacía atractivo para las pruebas experimentales de laboratorio para la proteína Leishmania NDK y NDK de otros patógenos; sin embargo, el fármaco miltefosina mostró baja afinidad molecular con el mismo proteína, corroborando los estudios en la literatura sobre la reducción de la eficacia de los medicamentos contra la leishmaniasis actuales.
  • 其他摘要:Leishmaniasis is an infectious disease that affects both animals and humans, caused by flagellated parasites belonging to the genus Leishmania may present in different clinical forms depending on the infecting strain and the immune reaction of the host. The disease is estimated to reach about 700,000 to 1 million people, causing the deaths of 20 to 30,000 individuals annually. Thus, the present study aims to perform a molecular coupling simulation of the ruthenium complex with epiisopiloturin and nitric oxide against the protein Nucleoside diphosphate kinase from Leishmania amazonensis . The NDK 3D molecule was extracted from the PDB nucleic proteins and acids database. The 3D molecular structure of the Epiruno 2 complex was designed using gaussview 5.0 software . The NDK target and Epiruno 2 complex were prepared for docking simulations, where NDK was considered rigid and Epiruno 2 was considered flexible. The Epiruno 2 complex presented a good molecular affinity rate with the target protein, making it attractive for experimental trials in laboratories for Leishmania's NDK protein and NDKs of other pathogens, however, the drug miltefosin presented low molecular affinity for the same target, corroborating studies presented in the literature on the reduced efficacy of current drugs against leishmaniosis.
  • 关键词:Biologia Computacional;Anti-Infecciosos;Trypanosomatina.;Biología Computacional;Antiinfecciosos;Trypanosomatina
  • 其他关键词:Computational Biology;Anti-Infective Agents;Trypanosomatina.
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