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文章基本信息

  • 标题:Grammatical inference applied to linguistic modeling of biological regulation networks
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  • 作者:Elias Bareinboim ; Ana Tereza Ribeiro Vasconcelos ; João Carlos Pereira da Silva
  • 期刊名称:RECIIS - Electronic Journal of Communication, Information & Innovation in Health
  • 电子版ISSN:1981-6278
  • 出版年度:2007
  • 卷号:1
  • 期号:2
  • 页码:1-5
  • DOI:10.3395/reciis.v1i2.Sup.104en
  • 出版社:Institute of Communication and Scientific and Technological Information in Health
  • 摘要:Apresentamos uma metodologia baseada em algoritmos de inferência gramatical aplicada à modelagem lingüística de redes de regulação biológicas. A abordagem lingüística para o problema de redes de regulação foi proposta por Collado-Vides, que provou e formalizou a necessidade de utilização de linguagens sensíveis ao contexto para representar tais redes. A aprendizagem de linguagens sensíveis ao contexto é uma tarefa difícil; nossa metodologia propõe descrever tal classe a partir de linguagens de natureza mais simples, que possam ser aprendidas por algoritmos de inferência gramatical já consolidados. Além da metodologia proposta, sugerimos direções para esta pesquisa que nos parecem promissoras.
  • 其他摘要:We present a methodology based on grammatical inference algorithms applied to the linguistic modeling of biological regulation networks. The linguistic approach to the problem of regulation networks was proposed by COLLADO-VIDES, who proved and formalized the need for use of context sensitive languages to represent such networks. The learning of context sensitive languages is a difficult task, our proposed methodology describes this class from language with a simpler nature that can be learned by already consolidated grammars inference algorithms. In addition to the proposed methodology, we suggest promising directions for this research.
  • 关键词:Regulação gênica; modelagem lingüística; linguagens sensíveis ao contexto; expressão regular aumentada; inferência gramatical
  • 其他关键词:Gene regulation;linguistic modeling;context sensitive language;augmented regular expression;grammatical inference
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