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文章基本信息

  • 标题:Vantagens e limitações das ontologias formais na área biomédica
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  • 作者:Stefan Schulz ; Holger Stenzhorn ; Martin Boeker
  • 期刊名称:RECIIS - Electronic Journal of Communication, Information & Innovation in Health
  • 电子版ISSN:1981-6278
  • 出版年度:2009
  • 卷号:3
  • 期号:1
  • 页码:1-16
  • DOI:10.3395/reciis.v3i1.241pt
  • 出版社:Institute of Communication and Scientific and Technological Information in Health
  • 摘要:Propomos uma tipologia dos artefatos de representação para as áreas de saúde e ciências biológicas, e a associação dessa tipologia com diferentes tipos de ontologia formal e lógica, chegando a conclusões quanto aos pontos fortes e limitações da ontologia de diferentes tipos de recursos lógicos, enquanto mantemos o foco na lógica descritiva. Consideramos quatro tipos de representação de área: (i) representação léxico-semântica, (ii) representação de tipos de entidades, (iii) representação de conhecimento prévio, e (iv) representação de indivíduos. Defendemos uma clara distinção entre os quatro tipos de representação, de forma a oferecer uma base mais racional para o uso das ontologias e artefatos relacionados no avanço da integração de dados e interoperabilidade de sistemas de raciocínio associados. Destacamos que apenas uma pequena porção de fatos cientificamente relevantes em áreas como a biomedicina pode ser adequadamente representada por ontologias formais, quando estas últimas são concebidas como representações de tipos de entidades. Particularmente, a tentativa de codificar conhecimento padrão ou probabilístico pela utilização de ontologias assim concebidas é fadada à produção de modelos não intencionais e errôneos.
  • 其他摘要:We propose a typology of representational artifacts for health care and life sciences domains and associate this typology with different kinds of formal ontology and logic, drawing conclusions as to the strengths and limitations for ontology of different kinds of logical resources, with a focus on description logics. The four types of domain representation we consider are: (i) lexico-semantic representation, (ii) representation of types of entities, (iii) representations of background knowledge, and (iv) representation of individuals. We advocate a clear distinction of the four kinds of representation in order to provide a more rational basis for using of ontologies and related artifacts to advance integration of data and interoperability of associated reasoning systems. We highlight the fact that only a minor portion of scientifically relevant facts in a domain such as biomedicine can be adequately represented by formal ontologies when the latter are conceived as representations of entity types. In particular, the attempt to encode default or probabilistic knowledge using ontologies so conceived is prone to produce unintended, erroneous models.
  • 关键词:ontologia biomédica; lógica descritiva; ontologia formal; representação do conhecimento
  • 其他关键词:Biomedical ontology;description logic;formal ontology;knowledge representation
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