标题：Оценка распространенности и эпидемического потенциала штаммов древних и современных сублиний генотипа Beijing Mycobacterium tuberculosis в Омской области
其他标题：Assessment of the Prevalence and Epidemic Spread of Strains of Ancient, and Modern Sublineages of the Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype in Omsk Region
摘要：Актуальность. Распространение эпидемических и резистентных генотипов Mycobacterium tuberculosis представляет серьезную угрозу реализации национальной программы по борьбе с туберкулезом в России. Цель исследования – оценка тенденций развития эпидемического процесса туберкулеза и распространенности штаммов различных сублиний и кластеров генотипа Beijing М. tuberculosis в Омской области. Материалы и методы. В соответствии с общепринятым алгоритмом описательно-оценочного эпидемиологического исследования изучена заболеваемость, распространенность и смертность от туберкулеза в Омской области за период 2009–2019 годов. Изучена структура популяции M. tuberculosis в Омской области (n = 483). Культивирование M. tuberculosis, определение лекарственной чувствительности, выделение ДНК проведено стандартными методами. Принадлежность штаммов M. tuberculosis к генотипу Beijing, его сублиниям и кластерам B0/W148 и 94-32 определяли на основе анализа специфических маркеров с помощью ПЦР. Результаты. Заболеваемость туберкулезом сократилась в 1,9 раза и составила в 2019 г. 67,3 на 100 тыс. населения. Динамика распространенности туберкулеза и смертности также характеризовалась выраженной тенденцией к снижению. Более половины (n = 317, 65,6%) изолятов принадлежали к генотипу Beijing, в том числе к его древней (n = 44,13,9%) и современной (n = 273, 86,1%) сублинии. Современная сублиния Beijing включала штаммы кластеров В0/W148 (n = 94, 29,6%) и 94-32 (n = 178, 56,2%). Почти все древние штаммы Beijing были МЛУ (97,7%) и характеризовались предширокой и широкой ЛУ (52,2% против 19,4% среди современных сублиний (PR = 0,59; [95% ДИ 0,35–0,99]). Высокий уровень кластеризации резистентных штаммов древней сублинии (CR = 0,84) позволяет рассматривать их в качестве потенциально эпидемических для Омской области. Выводы. На фоне улучшения эпидемиологической ситуации по туберкулезу в Омской области в целом циркуляция мультирезистентных штаммов кластера Beijing B0/W148 и штаммов древних сублиний генотипа Beijing, ассоциированных с предширокой и широкой лекарственной устойчивостью, указывает на эпидемический потенциал этих геновариантов M. tuberculosis и подчеркивает необходимость их тщательного мониторинга в системе эпидемиологического надзора.
其他摘要：Relevance. The spread of the epidemic and resistant Mycobacterium tuberculosis genotypes presents a serious threat to the implementation of the national tuberculosis control program in Russia. The study aimed to assess the trends in the development of the epidemic process of tuberculosis and the prevalence of strains of different sublineages and clusters of the M. tuberculosis Beijing genotype in the Omsk region. Materials & Methods. Following the generally accepted algorithm of descriptive and evaluation epidemiological research, the incidence, prevalence, and mortality from tuberculosis in the Omsk region for the period 2009-2019 were studied. The structure of the M. tuberculosis population in the Omsk region was studied (n = 483). M. tuberculosis culture, drug susceptibility testing, DNA extraction were carried out by standard methods. The M. tuberculosis Beijing genotype and its sublineages and clusters B0/W148 and 94-32 were detected based on the PCR analysis of specific markers. Results. The incidence of tuberculosis decreased by 1.9 times and was 67.3 per100 ths in 2019. The dynamics of tuberculosis prevalence and mortality were also characterized by a pronounced decreasing trend. 65.6% (n = 317) of the isolates belonged to the Beijing genotype, which was represented by strains of ancient (n = 44, 13.9%) and modern (n = 273, 86.1%) sublineages. The latter one included two main clusters: B0/W148 (n = 94, 29.6%) and 94-32 (n = 178, 56.2%). Almost all ancient Beijing strains were MDR (97.7%), and were characterized by extensive drug resistance (XDR) and pre-XDR (52.2% versus 19.4% in modern sublineage (PR = 0.59; [95% CI 0.35÷0, 99]). The high level of clustering of strains of ancient sublineage (CR = 0.84) allows us to consider them as potential epidemics for the Omsk region. Conclusions. Despite the general improvement of the epidemiological situation with tuberculosis in the Omsk region, the circulation of MDR strains of the Beijing B0/W148 cluster and pre-XDR/XDR strains of an ancient sublineage of the Beijing genotype points to the epidemic potential of these M. tuberculosis genovariants and emphasizes the need for their careful monitoring in the epidemiological surveillance system.
关键词：туберкулез ; заболеваемость ; распространенность ; M. tuberculosis ; генотип Beijing ; древние сублинии
