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文章基本信息

  • 标题:In silico screening of brazilian semiarid compounds to identify potential drugs with glucocorticoid receptor interaction
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  • 作者:Aldo Barbosa Côrtes Filho ; Danyo Maia Lima ; Pâmala Évelin Pires Cedro
  • 期刊名称:Research, Society and Development
  • 电子版ISSN:2525-3409
  • 出版年度:2020
  • 卷号:9
  • 期号:9
  • 页码:1-17
  • DOI:10.33448/rsd-v9i9.7865
  • 出版社:Grupo de Pesquisa Metodologias em Ensino e Aprendizagem em Ciências
  • 摘要:O receptor glicocorticoide regula a resposta anti-inflamatória ao impedir a transcrição de proteínas pró-inflamatórias, como o fator nuclear kB e lipocortina-1, IL-2, IL-6, TNF e prostaglandinas. Dessa forma, a busca de novas moléculas com potencial interação com o receptor glicocorticoide é uma estratégia interessante para o tratamento de doenças inflamatórias. A triagem virtual tem se demostrado uma ferramenta viável para a descoberta de novos fármacos, pelo baixo custo e praticidade. Assim, o objetivo deste estudo é identificar e avaliar os compostos do semiárido brasileiro com potencial anti-inflamatório com ação no receptor glicocorticoide, através do acoplamento molecular. A seleção da proteína se deu através da busca no banco de dados de estruturas 3D, Protein Data Bank. Foram utilizadas um total de 382 moléculas do semiárido disponíveis no banco de dados ZINC, pela Universidade Estadual de Feira de Santana (UEFS). O docking molecular foi realizado utilizando o Autodock Vina e as nuvens de interações foram analisadas pelo programa Discovery Studio Visualizer. O Furoato de Mometasona apresentou energia de ligação de -12,7 Kcal.mol-1. A molécula ZINC 69481862 se enquadrou nas regras de Lipinski e Veber, entretanto, a melhor interação foi da molécula ZINC 69482012, evidenciada pela energia de ligação -11,2 Kcal.mol-1. Análises das interações intermoleculares demonstraram que as interações de Van der Waals e ligações eletrostáticas são cruciais para a ligação da molécula no sitio ativo do receptor. Faz-se necessário testes in vitro para averiguar a viabilidade e toxicidade do potencial fármaco.
  • 其他摘要:The glucocorticoid receptor regulates the anti-inflammatory response, and prevents transcription of anti-inflammatory substances such as nuclear factor kB and lipocortin-1, IL-2, IL-6, TNF and prostaglandins. Thus, a search for new molecules with potential interaction with the glucocorticoid receptor is an interesting strategy for the treatment of inflammatory diseases. Virtual screening has proven to be a viable tool for discovering new products at lower cost and practicality. Thus, the aim of this study is to identify and evaluate brazilian semiarid compounds with anti-inflammatory potential with glucocorticoid receptor action through molecular coupling. Protein selection was performed by searching the 3D structure database, Protein Data Bank. A total of 382 semi-arid molecules available in the ZINC database of State University of Feira de Santana (UEFS) were used. Molecular docking was performed using Autodock Vina and as interaction clouds analyzed by the Discovery Studio Visualizer program. Mometasone furoate shows a binding energy of -12.7 Kcal.mol-1. A ZINC 69481862 molecule fits Lipinski and Veber rules, however, the best interaction was the ZINC 69482012 molecule, evidenced by the binding energy -11.2 Kcal.mol-1. Analyses of intermolecular interactions have shown that Van der Waals interactions and electrostatic bonds are crucial for the binding of the molecule at the receptor's active site. It is necessary to test in vitro to verify the viability and toxicity of the potential drug.
  • 关键词:Virtual Screening; Molecular Docking; Anti-inflammatory Potential; Glucocorticoid Receptor.
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