摘要：Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengembangkan model struktur organisasi di pesantren yang memiliki keterkaitan dan pengaruh dengan efektivitas organisasi. Penelitian ini merupakan penelitian kuantitatif dengan analisis pemodelan persamaan struktural. Sumber data dari 273 pengelola dikumpulkan dari 98 unit profit dan non profit yang ada di Pesantren. Untuk menganalisis data peneliti menggunakan Partial Least Square (PLS-SEM) dengan Smart PLS 2.0 sebagai alat bantu. Hasil dari penelitian ini diperoleh hasil korelasi sebesar 0,553 yang berarti terdapat hubungan antara struktur organisasi dengan efektivitas organisasi pada level menengah. Hasil koefisien determinasi menunjukkan 0,305 (30,5%) bahwa terdapat pengaruh yang signifikan dari struktur organisasi terhadap efektivitas organisasi di pesantren.
