文章基本信息
- 标题:生命科学におけるセマンティック・ウェブのグラフ構造データの可視化
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- 作者:片山 俊明
- 期刊名称:可視化情報学会誌
- 印刷版ISSN:1346-5252
- 电子版ISSN:1884-037X
- 出版年度:2020
- 卷号:40
- 期号:156
- 页码:19-24
- DOI:10.3154/jvs.40.156_19
- 出版社:Japan Science and Technology Information Aggregator, Electronic
- 摘要:生命科学・医科学の分野では多数の公共データベースが公開されているが、ライフサイエンス統合データベースセンターではこれらを統合的に利用するための技術開発を進めており、セマンティック・ウェブ技術を使ったデータ統合を行ってきた。セマンティック・ウェブではデータがグラフ構造で繋がっているが、本稿ではそのデータモデルResource Description Framework (RDF)、検索のためのSPARQL Protocol and RDF Query Language (SPARQL)、SPARQL検索の結果をREST API化するSPARQListを概説し、RDF/SPARQLを用いて構築した統合ゲノムデータベースTogoGenomeとその可視化モジュールTogoStanzaを紹介する。さらに、汎用化したMetaStanzaによる任意のSPARQLの検索結果の可視化と、可視化の際に必要なd3spraql.jsによるデータの形式変換および、現在利用可能な生命科学・医科学分野のRDFデータセットについて解説した。.