Este artigo tem por objetivos apresentar a organização hospitalar como um sistema complexo sob a luz da Teoria Geral de Sistemas em busca do entendimento das dificuldades de comunicação entre seus subsistemas e propor mediante a atual capacidade computacional das ontologias em saúde, a telemática como uma ferramenta baseada nas tendências das novas Tecnologias de Informação e Comunicação, em busca de uma comunicação eficaz entre os profissionais de saúde, pacientes e organização hospitalar.