标题：Od sekvencije DNA do kemijske strukture – pretraživanje mikrobnih genomskih i metagenomskih skupova podataka radi pronalaženja novih prirodnih spojeva
摘要：Brzo pretraživanje genomskih i metagenomskih skupova podataka, modularnih biosintetskih genskih nakupina poliketid sintaza i sintetaza neribosomalno sintetiziranih peptida, postignuto je primjenom generičkih računalnih programskih paketa ClustScan i CompGen. Ti programski paketi provode anotaciju hijerarhijskim strukturiranjem podataka na polipeptide, module i domene, te pohranu i grafičku prezentaciju tih podataka. Na temelju dosadašnjih spoznaja, nastoji se postići najtočnije moguće predviđanje aktivnosti i specifičnosti katalitički aktivnih domena, što vodi prema predviđanju najvjerojatnijih kemijskih struktura koje ti enzimi mogu sintetizirati. Programski paketi ClustScan i CompGen omogućuju generiranje novih genskih nakupina homolognom rekombinacijom anotiranih gena u uvjetima in silico, a upotrijebljeni su i za konstrukciju vlastitih baza podataka poznatih poliketidnih i peptidnih supstancija (CSDB) te potpuno novih poliketidnih i peptidnih supstancija produkata rekombinacije (r-CSDB). Ti će se produkti rekombinacije moći upotrijebiti za izbor supstancija s potencijalnom biološkom aktivnošću pomoću računalom vođenog dizajna lijekova u uvjetima in silico. Primjenjivost programskih paketa ClustScan i CompGen dokazana je u analizi genomskih sekvencija prokariotskih i eukariotskih mikroorganizama što žive u tlu, analizi metagenomske skupine podataka u uzorku iz morske vode, a i na nedavno opisanom primjeru 'zajedničkog metaboličkoga puta' u mikrobnog endosimbionta morske životinje.
