首页    期刊浏览 2025年06月16日 星期一
登录注册

文章基本信息

  • 标题:Analiza sinergizama u biokemijskim mrežama
  • 本地全文:下载
  • 作者:Kurtanjek, Želimir
  • 期刊名称:Food Technology and Biotechnology
  • 印刷版ISSN:1330-9862
  • 电子版ISSN:1334-2606
  • 出版年度:2010
  • 卷号:48
  • 期号:3
  • 页码:368-375
  • 出版社:Sveuciliste u Zagrebu - Faculty of Food
  • 摘要:U radu je predložen pristup analizi sinergizma u matematičkim modelima biokemijskih mreža na osnovi teorije vjerojatnosti. Zasniva se na gledištu da se informacija o značajnosti parametra ocjenjuje kao dio interakcije svih parametara modela. Naprimjer, ovim se pristupom uzima u obzir nesigurnost u procjeni aktivnosti enzima i kinetičkih parametara koji sudjeluju u kinetičkom modelu mreže i/ili koncentracije metabolita i kofaktora uključenih u interakciju između metaboličkog puta i perturbacija unutar stanice. Parametri se promatraju kao slučajne varijable s pretpostavljenim pripadajućim raspodjelama vjerojatnosti i određuje se ukupni učinak njihove varijabilnosti na metaboličke tokove u mreži. Kvantitativna mjera sinergizma pojedinih parametara, koji su u interakciji s parametrima modela, definira se kao razlika između cjelokupne očekivane vrijednosti uvjetovane varijance komplementarnih parametara i varijance uvjetovane očekivane vrijednosti pojedinog parametra. Ta se razlika izražava relativno s obzirom na ukupnu varijancu. Da bi se to ilustriralo, predloženi je postupak primijenjen za dva jednostavna primjera i jedan kompleksni model. Prvi je primjer analiza sinergizma između aktivatora i supstrata u mehanizmu „uni-uni tip I“, a drugi evaluacija sinergizma između enzima koji serijskim nizom reakcija sudjeluju u metaboličkom toku. Kao primjer složenog sustava analiziran je sinergizam interakcije fluksa glikogenolize u mišićnoj stanici i kofaktora na razini cjelokupne stanice.
  • 关键词:sinergizam; analiza sustava; biokemijske mreže; MathSBML; FAST
国家哲学社会科学文献中心版权所有