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  • 标题:Validación y adaptación de la técnica de microsatélites para el análisis genético de Vochysia guatemalensis Donn. Sm.
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  • 作者:Fabiana Rojas ; Olman Murillo ; Emanuel Araya
  • 期刊名称:Foresta Veracruzana
  • 印刷版ISSN:1405-7247
  • 出版年度:2007
  • 卷号:9
  • 期号:1
  • 页码:1-8
  • 语种:Spanish
  • 出版社:Recursos Genéticos Forestales
  • 摘要:Con los avances hacia la reforestación clonal del sector forestal en Costa Rica y en muchos otros países, surgen nuevas necesidades. Es imprescindible poder verificar la pureza de las colecciones clonales; revisar el nivel de parentesco y el grado de variabilidad en la población de mejoramiento, entre otras aplicaciones. El uso de marcadores genéticos, como los microsatélites (SSR), constituyen una nueva e invaluable herramienta para precisamente poder garantizar y respaldar los programas de mejoramiento y conservación genética forestal. En este trabajo se presenta la adecuación y validación del uso de varios microsatélites en Vochysia guatemalensis, que habían sido previamente desarrollados para Vochysia ferruginea. El método de extracción de ADN utilizado basado en CTAB permitió su obtención en alta calidad, determinada por medio de un gel de agarosa al 1%. La evaluación inicial de la amplificación basada en el protocolo reportado para Vochysia ferruginea, no mostró los resultados esperados, por lo que fue necesario optimizar un nuevo protocolo para Vochysia guatemalensis. La validación de la técnica de microsatélites para la identificación clonal permitió descartar uno de los cinco imprimadores evaluados (A1-26). El tamaño de los alelos encontrados difiere con los reportados para V. ferruginea. El valor promedio del tamaño de los alelos en pb más cercano a lo reportado para V. ferruginea, se obtuvo con el imprimador A1-35. Los cuatro loci estudiados presentan alto grado de polimorfismo (4, 4, 3 y 2 alelos respectivamente), lo cual los hace marcadores apropiados para el aseguramiento de la identidad genética de las colecciones clonales de esta especie.
  • 其他摘要:Recent advances in clonal forestry in Costa Rica and internationally as well, generates new needs. It is now mandatory to be able to guaranty genetic purity in clonal collections; to control the inbreeding and genetic variability in breeding populations, among other applications. Gene markers usage and late developments, like with microsatellites (SSR), constitute a new and invaluable tool for guaranteeing and certifying genetic identity in gene conservation and breeding programs in forestry. In this work is presented the adaptation and validation of microsatellites in Vochysia guatemalensis, that had been previously developed for V. ferruginea. DNA extraction method, based on CTAB, allowed a high quality material, determined through agarosa gels (1% concentration). Initial amplification evaluation, based on a previous protocol for Vochysia ferruginea, showed non expected results, therefore, a new protocol for V. guatemalensis was needed and developed. The validation process resulted in the elimination of one of the five primers analyzed (A1-26). Alleles size found was different from reported in V. ferruginea. The closer to V. ferruginea average allele size (in bp) was determined for primer A1-35. The four investigated loci showed high degree of polymorphism (4, 4, 3 and 2 alleles respectively), which allowed them to be utilized as appropriated primers for V. guatemalensis
  • 关键词:Vochysia guatemalensis; microsatélites; SSR; PCR; Costa Rica. Vochysia guatemalensis; microsatellite; SSR; PCR; Costa Rica.
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