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文章基本信息

  • 标题:Caracterización computacional de los epitopes B de la quitinasa clase I de la Ananas comosus (Piña)
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  • 作者:César Muñoz Mejía ; Jefferson Méndez ; Ricardo Vivas Reyes
  • 期刊名称:Salud Uninorte
  • 印刷版ISSN:0120-5552
  • 电子版ISSN:2011-7531
  • 出版年度:2011
  • 卷号:27
  • 期号:1
  • 页码:1-10
  • 语种:Spanish
  • 出版社:Universidad del Norte
  • 摘要:Objetivos: Determinar el potencial alergénico de la quitinasa de piña y proponer un modelo computacional de la estructura de esta proteína para la predicción de posibles sitios de unión a la IgE, a los Epitopes E, los que se encuentran implicados en las reacciones alérgicas de esta fruta. Métodos: A partir de una secuencia de bases de ADN de piña, previamente reportada, que traduce para una proteína con homología a diferentes quitinasas de otras frutas, y mediante el uso de herramientas bioinformáticas y bases de datos disponibles en la red, se obtuvo un modelo computacional de quitinasa de piña y se analizaron su estructura y características fisicoquímicas para la predicción de epítopes dentro de la misma. Resultados: Se generó un modelo computacional de una proteína de 204 aminoácidos, que pertenece al grupo de las quitinasas I. La predicción y posterior análisis de Epitopes obtenidos a partir de varios servidores bioinformáticos mostró que estos tienen características (Área de Superficie Relativa, RSA) que los hacen aptos para pertenecer a un sitio de unión a IgE. Conclusiones: La quitinasa de piña estudiada posee homología con uno de los grupos de alérgenos de alimentos que está implicado en el síndrome látexfruta, y podría ser la responsable de reacciones alérgicas a este alimento. Por otro lado, poder predecir estos epítopes es de utilidad también en el diseño de alimentos transgénicos.
  • 其他摘要:Objectives: To determine the allergenic potential of pineapple¿s chitinase and propose a bioinformatic model of the structure of this protein for the prediction of possible epitopes E, that would be related in allergic reactions to this fruit. Methods: From a DNA sequence of pineapple, previously reported, that translates for a protein similar to chitinases from other vegetable, using bioinformatic tools and databases available online, we obtained a computational model of pineapple¿s chitinase that was analyzed physically and chemically for the prediction of epitopes. Results: The model was generated as a 204 aminoacids protein, that was classified as a chitinase class I. The prediction and analysis of epitopes from multiple bioinformatic servers showed that they have properties (Relative Surface Area, RSA) which make them capable to be part of antigenic site. Conclusions: Pineapple¿s chitinase generated had similarities with a group of food allergens that has been related in the latexfruit syndrome, and could be responsible of allergies to this fruit. In addition, the ability to identify these epitopes is also useful in the design of Genetically Modified Foods.
  • 关键词:Piña; quitinasa; heveína; alérgeno; bioinformática; epítope; reactividad cruzada; in silico;Pineaple; chitinase; heveth; allergenes; bioinformatics; epitope; cossreactivity; in silico
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